Perry stał się sławny po jego eksperymentach z innowacyjnymi metodami miksowania muzyki i uzyskiwaniu specjalnych efektów dźwiękowych w studio. Jego metody nazywane były "dub music" (określenie pochodzące od dubbingu) i zrewolucjonizowały nie tylko muzykę reggae, ale także hip hop, dance i inne gatunki.
Nazywany był "czarodziejem reggae", który wprowadził elementy afrykańskie do tej muzyki. To właśnie on przekonał Marleya i jego zespół The Wailers do swoich metod wykonawczych i rejestracji dźwięku co doprowadziło ich na szczyt popularności.
Lee "Scratch" Perry współpracował z takimi gwiazdami jak: Beastie Boys, The ORB, The Clash, Adrian Sherwood, Mad Professor.
W 2003 roku Perry otrzymał nagrodę Grammy w kategorii Best Reggae Album za płytę "Jamaican E.T.", zaś rok później magazyn Rolling Stone umieścił go na 100 miejscu listy "100 Największych Artystów Wszech czasów".